В работе всесторонне изучается методология полногеномного поиска зависимости фенотипа с одним или несколькими генотипами. В данной части работы обсуждается проблема интерпретации результатов множества тестов, реализация статистических методов, описанных в первой части работы, на языке программирования R и особенности использования статистических методов в комплексных исследованиях заражаемости ВИЧ и развития СПИД. Также будут предложены некоторые соображения, касающиеся интерпретации результатов однотипных статистических тестов, полученных на базе независимых экспериментов. С. 3-17.

Methodology of genome association discovery is discussed comprehensively in this paper. The multiple testing problem, implementation of the statistical methods discussed in the first part of the paper and their applications in HIV-infection and AIDS progression studies are considered here. Several ideas on common interpretation results of independent or dependent similar tests will be given too.