Содержание журнала, редсовет, редколлегия, информация об обложке.

Table of contents, editorial board, editors, information on cover.

В работе рассматриваются две задачи анализа данных геномного и метагеномного секвенирования — задача de novo сборки генома (сборка неизвестного генома) и задача сравнительного анализа метагеномов, которая возникает при анализе геномов микроорганизмов из почв, океанов, кишечника человека и т. д. Несмотря на то, что эти задачи в основном возникают у исследователей, работающих в области биологии, их использование в образовательных целях — необходимый шаг при обучении молодых медиков, биологов и биоинформатиков, а также для повышения квалификации специалистов из этих областей. В настоящей статье приводится обзор методов сборки генома и сравнительного анализа метагеномов, исследуется вопрос применимости существующих средств для обучающихся и предлагаются новые подходы к решению данных задач. Такие подходы использовались авторами при обучении студентов в Санкт-Петербургском политехническом университете Петра Великого. В работе также приводятся результаты экспериментов по сравнению предложенных подходов с известными. С. 5-15.

In this paper we address two problems of analyzing genome and metagenome sequencing data — de novo genome assembly problem (assembly of an unknown genome) and problem of comparative metagenome analysis which arises in the analysis of microorganisms in soil, sea, human gut, etc. Despite these problems are of interest to scientists working in the biology area, using them for education is essential for teaching medical students, biologists, bioinformaticians and also in the process of further training of specialists in this areas. In this paper we present a survey of methods for de novo genome assembly and comparative metagenome analysis, examine the possibility of using such approaches in educational processes and propose novel approaches for solving these problems. Proposed solutions have already been used for educating students in the Peter the Great St.Petersburg Polytechnic University. In this paper we also present the results of experiments of comparing proposed methods against known ones.

Очень часто непосредственное использование стандартных моделей приводит к результатам низкого качества. В статье рассмотрены два примера. Первый пример касается классификации популярных данных «Credit», полученных с платформы Kaggle. В качестве классификатора мы используем стандартную функцию nnet (нейронные сети) в программной среде R. Проблема состоит в том, что данные «Credit» являются несбалансированными, а функция nnet склонна игнорировать класс, который составляет меньшинство. В качестве решения проблемы несбалансированности мы предлагаем рассмотреть большое число относительно небольших и сбалансированных подмножеств, в которых элементы из тренировочной базы данных отбираются случайным образом. Второй пример касается широкоизвестных данных MNIST при использовании стандартной функции svm (метод опорных векторов) в среде Python. Показана необходимость нормализации исходных признаков. С. 16-24.

In many cases direct application of the standard classification models leads to poor quality of results. In this paper we consider two examples. The subject of the first example are popular imbalanced data «Credit» from the platform Kaggle. Standard function nnet (neural networks) in the program environment R is used as a classificator. This function is ignoring an important minority class. As a solution to this problem, we are proposing to consider a large number of relatively small and balanced subsets, where elements were selected randomly from the training set. The subject of the second example are famous data MNIST and standard function svm (support vector machine) in the environment Python. The necessity of normalisation of the original features is demonstrated.

В статье приводятся некоторые классические задачи комбинаторики, которые в том числе можно решать с помощью компьютера. Среди этих задач проблема Борсука о разбиении множеств на части меньшего диаметра и задачи теории Рамсея. С. 25-31.

In the paper we present some classical problems of combinatorics, which admit computer-aided solutions. Among these problems, we have Borsuk's problem on partitioning sets into parts of smaller diameter and problems of Ramsey theory.

В статье рассматриваются визуальные среды программирования роботов, используемые в образовательных целях. Вводится система критериев, важных для преподавания информатики и робототехники, приводится обзор и сравнение большого количества сред. Также представлена оригинальная разработка авторов — среда программирования роботов TRIK Studio. С. 32-49.

This article provides a detailed survey on educational visual robotic programming tools. Work introduces a set of numeric criteria used for the comparison of widely-used educational robotic programming tools. Also a novel robotic programming environment called TRIK Studio developed by authors is introduced.

В статье приведен простой геометрический вывод границы «области безопасности» в случае семейства кеплеровых орбит спутников или баллистических снарядов, движущихся в центральном поле тяготения, и в случае семейства параболических траекторий снарядов, запущенных в однородном поле тяжести из общей начальной точки с равными скоростями. Рассмотрены примеры практического применения огибающей семейства орбит для решения задач баллистики. Приведенные примеры иллюстрируются компьютерным моделированием. С. 50-65.

The paper presents a simple geometric derivation for the “safety domain” boundary for the family of Keplerian orbits of satellites or ballistic missiles, moving in a central field of gravity, and for the family of parabolic trajectories of projectiles in a uniform gravitational field launched from a common starting point at equal velocities. Examples of practical application of the envelope of a family of orbits for solving ballistics problems are discussed. These examples are illustrated by computer simulations.

Заметка освещает основные цели и задачи проекта об открытиях современной российской науки «Входите — Открыто!», а также некоторые его результаты — создание научно-популярных фильмов и брошюр. Кроме того, в тексте рассматривается вопрос оценки актуальности и эффективности проекта с точки зрения ее целевой аудитории — детей и подростков. С. 66-68.

The article covers the main targets and tasks of the “Come in — it’s open!” project about achievements of the modern Russian science and some of its results — creation of popular science films and brochures. Besides that the text also contains information about the project’s efficiency and its evaluation by the target audience — children and teenagers.